В зависимости от этого подбирается соответствующее оборудование (в первом случае необходима молотковая мельница, а во втором — шаровая). Имеет значение также и тип корней: для волокнистых корней применяется один тип машин, а для неволокнистых — другой. Необходимо учитывать и влажность сырья: сырье должно быть обязательно подсушено до остаточной влажности 6—8 %. Для измельчения лекарственных веществ, образующих ядовитую или раздражающую пыль, применяют наименее пылящие шаровые мельницы. Измельчение ведут в отдельных помещениях, при этом мельницы закрывают специальными кожухами. В процессе измельчения применяют меры личной безопасности, используя специальную одежду для персонала. Сборный измельчитель GF-300A, применяемый в современной фармацевтической промышленности, состоит из следующих составных деталей: измельчителя, пылесборника и сборника для сырья. Принцип работы заключается в следующем: после загрузки в бункер сырье попадает между фиксированными и подвижными зубчатыми дисками, которые вращаются с высокой скоростью. Сырье превращается в порошок посредством пульсирующего бурления, резки, растирания, а также посредством сталкивания гранул различного размера. Все рабочие части изготовлены из нержавеющей стали высокого качества. Измельчитель произведен в соответствии со стандартом GMP. В струйной мельнице CGS немецкой компании NETZSCH энергия измельчения образуется за счет подачи газовых струй через горизонтально встроенные воздушные сопла. Газовые струи создают псевдоожиженный слой, в котором частицы ускоряются за счет газовой струи.  При движении в центр и в самом центре камеры частицы сталкиваются с другими частицами, движущимися медленнее, и таким образом происходит измельчение. Появляющийся в центре камеры воздух «транспортирует» частицы к классификатору, который в свою очередь отсеивает слишком грубые частицы и пропускает только частицы, которые по параметрам соответствуют настройкам, таким как число оборотов классификатора и количество воздуха.

При помощи струйной мельницы CGS возможно достичь дисперсности частиц в диапазоне 2— /0 мкм. Желаемая дисперсность устанавливается через вращающийся классификатор. В зависимости от медицинского назначения и способа применения к порошкам предъявляют различные требования в отношении дисперсности.  Кристаллические порошки, предназначенные для растворения перед употреблением их больными (например, магния сульфат, борная кислота), обычно отпускают в виде средних, среднемелких и даже крупных порошков. Порошки-присыпки, предназначенные для лечения различных повреждений кожи или слизистых оболочек, должны иметь высокую степень дисперсности с целью увеличения суммарной поверхности частиц этих веществ и уменьшения их травмирующего воздействия.  Например, в содержащих кальций зубных пастах кальций находится в виде тонких игольчатых кристаллов, чтобы эти кристаллы могли заполнить трещины эмали зубов. При изготовлении порошков необходимо учитывать физико-химические свойства лекарственных и вспомогательных веществ. При изготовлении сложных порошков учитывают: размер и форму кристаллов, растворимость в этаноле, способность к адсорбции (в том числе красящая способность), способность электризоваться (сера, бутадион) и распыляться (магния оксид), летучесть (ментол, камфора, эфирные масла и др.). Трудноизмельчаемые вещества (камфора, ментол, йод) измельчают в присутствии летучих растворителей — спирта или эфира, которые являются ПАВ (10 капель спирта или 15 капель эфира на 1 г вещества). Они облегчают процесс разрушения, производят расклинивающий эффект и, адсорбируясь на мельчайших частицах, препятствуют агрегации, стабилизируют порошковую массу.  Вещества, обладающие красящими свойствами, вводят, избегая их непосредственного и длительного контакта с измельчающими поверхностями аппаратуры. Во избежание увлажнения порошковой смеси и для улучшения измельчения некоторые вещества (натрия и магния сульфаты, квасцы) целесообразно использовать подсушенными, предварительно подсушив их при температуре 40—50°С.