El componente principal de las microcápsulas, la sustancia a encapsular, puede estar en cualquier estado agregado: líquido, sólido, gaseoso. Los métodos existentes proporcionan la posibilidad de microencapsulación de sustancias tanto liófilas como liófobas. El contenido de las microcápsulas puede incluir un relleno inerte, que es el medio en el que se dispersó la sustancia en el proceso de microencapsulación, o es necesario para el funcionamiento posterior de la sustancia activa. El contenido de la sustancia encapsulada en las microcápsulas es típicamente del 50-95% del peso de las cápsulas. Este valor puede variar según la tecnología y las condiciones de producción, la proporción requerida de material de cubierta y sustancia encapsulada, así como otros parámetros del proceso: temperatura, grado de dispersión,viscosidad del medio, presencia de tensioactivos, etc. El término «microcápsulas » o» nanocápsulas » puede referirse a muchas estructuras diferentes. Se pueden usar moléculas dentro de las cuales está atrapado el ingrediente activo, así como complejos de moléculas complejas a partir de las cuales se forman nanocápsulas o nanoesferas. Se dice que la nanoencapsulación ocurre cuando el tamaño de las moléculas es inferior a unos pocos micrómetros. Cuando el tamaño de las moléculas es inferior a un milímetro, hablamos de microencapsulación. Se pueden usar diferentes clases de sustancias como material de cubierta o matriz encapsulante: Ceras y lípidos: cera de abejas, ceras de candelilla y carnuba, emulsiones de cera, diestearato de glicerol, grasas naturales y modificadas. Proteínas: gelatina, proteínas de trigo, proteínas de soja, ceína, gluten, etc. Se utilizan tanto las proteínas en sí mismas como sus modificaciones. Hidratos de carbono: almidones, maltodextrinas, quitosano, sacarosa, glucosa, etilcelulosa, acetato celulosa, alginatos, etc.

Polímeros degradables: polipropileno, acetato de polivinilo, poliestireno, polibutadieno, etc. La elección del material de las cubiertas o matriz de encapsulación depende del propósito, las propiedades y el método de liberación del agente de encapsulación, así como del método de microencapsulación elegido. El contenido de las microcápsulas puede liberarse por destrucción mecánica de las cubiertas bajo presión, por fricción, acción ultrasónica, fusión, por ruptura desde el interior por vapores o sustancias gaseosas liberadas en condiciones externas cambiantes, por interacción de la sustancia de la cubierta con el medio cuando se disuelve en ella, así como por difusión del contenido cuando las paredes de la cápsula se hinchan en el líquido circundante. Los métodos existentes de microencapsulación se pueden dividir en tres grupos principales: Los métodos físicos de microencapsulación se basan en métodos de formación de conchas mediante técnicas mecánicas. Este grupo de métodos incluye recubrimiento en lecho fluidizado, extrusión usando centrífugas o mediante dispositivos formadores de tubo en tubo, condensación de vapor (pulverización al vacío). Los métodos químicos se basan en transformaciones químicas que conducen a un material formador de película, a saber, la formación de una nueva fase mediante reticulación de polímeros, policondensación y polimerización. Tanto las sustancias de alto peso molecular (oligómeros o polímeros) como las sustancias de bajo peso molecular pueden someterse a transformaciones químicas. Los métodos fisicoquímicos incluyen coacervación, precipitación de polímero formador de película a partir de medio acuoso mediante la adición de un componente que reduce su solubilidad, formación de una nueva fase por cambio de temperatura, evaporación de un disolvente volátil, solidificación de masas fundidas en medios líquidos, sustitución de extracción, secado por pulverización y adsorción física. Al seleccionar un método de microencapsulación, se deben considerar varios factores importantes.