Für die meisten Nutzpflanzen bleibt jedoch die Gefriertrocknung die einzig geeignete Methode. Neuere Forschungen von Wissenschaftlern haben gezeigt, dass Sprühtrocknung und Gefriertrocknung in einem einzigen Verfahren kombiniert werden können, um proteinreiche Trockenpulver herzustellen, wobei der Hauptvorteil darin besteht, ein hochdisperses Produkt zu erhalten.
Der Prozess wurde in zwei Schritten durchgeführt: Sprühen der Lösung in einem mit flüssigem Stickstoff gefüllten Metallbehälter unter ständigem Schütteln; Gefriertrocknung in einem Crist-Vakuum-Lyophilisator. Gleichzeitig ist die Qualität der mit der kombinierten Methode getrockneten Produkte (Erhaltungsgrad wertvoller Eigenschaften, ursprüngliche Struktur, Aktivität der Inhaltsstoffe) der im Vakuum gefriergetrockneten nicht unterlegen.

Die Produkte haben eine bessere Sperrigkeit und Morphologie und es findet kein Sintern der Deckschicht statt. Die so erhaltenen Pulver können zur weiteren Verkapselung, Verpressung, epidermalen Applikation sowie zur Erhöhung der Löslichkeit schwerlöslicher Substanzen verwendet werden. Einige Wissenschaftler haben auch die Auswirkung der Trocknungsmethode auf die Pulverfriabilität untersucht, die von einer Kombination verschiedener Faktoren abhängt: Größe, Form und Oberflächeneigenschaften der Partikel. Der Vergleich von Sprüh- und kombinierten Sprüh- und Gefriertrocknungsverfahren wurde anhand von Indikatoren wie Partikelgröße und -form, Feuchtigkeitsgehalt, physikalischen und chemischen Eigenschaften, Einfluss von Additiven und Beschichtungen auf die Bröckeligkeit von Pulvern durchgeführt.